Selain ke Anambas, kapal ini rencananya juga melayani rute Tanjunguban, Tambelan, Sintete, dan Serasan.
Untuk di Anambas, kapal dijadwalkan bakal sandar di Pulau Matak.
Berikut rencana jadwal operasi KMP Bahtera Nusantara 01:
Berangkat:
Rabu: pukul 20.00 WIB, lintasan Tj.Uban - Matak
Jumat: pukul 10.00 WIB, lintasan Natuna - Serasan.
Sabtu: pukul 10.00 WIB, lintasan Sintete - Serasan.
Minggu: pukul 08.00 WIB, lintasan Natuna - Matak.
Rabu: pukul 20.00 WIB, lintasan Tj. Uban - Tambelan.
Jumat: pukul 09.00 WIB, lintasan Sintete - Tambelan.
Rabu: pukul 20.00 WIB, lintasan Tj. Uban - Matak.
Sabtu: pukul 10.00 WIB, lintasan Sintete - Serasan.
Minggu: pukul 08.00 WIB, lintasan Natuna - Matak.
Rabu: pukul 20.00 WIB, lintasan Tj.Uban - Tambelan.
Jumat: pukul 09.00 WIB, lintasan Sintete - Tambelan.